1990年1月22日，经国务院批准，霸县改设霸州市，为省辖县级市，由廊坊市管理。行政区划未变。

1992年11月，经省政府批准从霸州镇划出付庄、宋庄、小何庄，从临津乡划出大何庄、北燕家务北头村、北燕家务南头村等6个行政村，成立霸州市省级火炬产业园区。1996年9月，改称霸州经济技术开发区。

1996年4月，按照河北省指示并乡扩镇，老堤乡与霸州镇合并为霸州镇。临津乡与岔河集乡合并为岔河集乡。辛店乡与康仙庄乡合并为康仙庄乡。中口乡与信安镇合并为信安镇。辛章乡与东段乡合并为东段乡。褚河港乡与扬芬港乡合并为扬芬港乡。霸州市辖 12个乡镇。即霸州镇、南孟镇、煎茶铺镇、信安镇、堂二里镇、胜芳镇、岔河集乡、康仙庄乡、东杨庄乡、王庄子乡、东段乡、扬芬港乡。

同年7月，霸州市成立城区办事处。从霸州镇辖区划出城五街、城六街、北关、朱庄、迎恩、冯庄、挂甲庄、孟家坟、范家坊、大魏营、小魏营11个村街，从康仙庄乡划出北杨乡庄村和市区内的康复道、建设道、兴建街、文苑里4个居委会，组成城区办事处。

1998年9月，与东段乡合并的辛章乡从东段乡析出，成立辛章办事处。至2003年，霸州市共辖6个镇，6个乡，1个开发区，2个办事处。即：霸州镇、胜芳镇、南孟镇、煎茶铺镇、信安镇、堂二里镇、岔河集乡、康仙庄乡、东杨庄乡、王庄子乡、东段乡、扬芬港乡、霸州经济技术开发区、城区办事处，辛章办事处。（《霸州市志》2006年版）